micli1973 wrote:
我的認知與個人腦補
COVID-19是存在已久的病毒(種類)
西方科學 新發現 重新定義它(其實是包裝它 )
存在很久? 從2019年開始造成大流行, 至今第四年
前面解釋過, 從RNA基因定序 , 祖先類型標記為“A”，並將衍生類型標記為“B”。B 型突變為更多類型，包括 B.1，它是全球關注的主要變種的祖先，世界衛生組織於 2021 年將其標記為alpha、beta、gamma、delta和omicron等變種 。
病毒的構造很簡單,只有外殼的蛋白+內部的遺傳物質DNA或RNA , 沒有胞器, 它無法單獨存活, 病毒必需依賴不斷侵入宿主,利用宿主才能複製自己而存活下來 。
病毒需要有宿主 , 無法單獨存活
若是存在已久的病毒 ? 為何存在已久沒看到宿主發病?到2019年才爆發 ?
武漢爆發COVID-19的時間,絕對不是在2019年的10月,11月,而是更早, 不只美國,當時參加武漢軍人運動會各國選手, 事後都被測到有"抗體"
其中加拿大隊因染病者眾，在返國軍機內設置隔離區。加拿大隊於當年10月15日抵達武漢時,就發現城市空無一人，學校都關閉了，起重機靜止不動，幾乎沒有汽車，周圍也幾乎沒有人?被告之是因為軍運而封鎖
星期日郵報報導法國、意大利、盧森堡和瑞典,德國Jacqueline Bock 及其隊友在武漢病倒，意大利Matteo Tagliariol和同住公寓的人都出現了新冠病毒癥狀，高燒、劇烈咳嗽和呼吸困難。
軍運會結束後，美國運動員返回全國200多個軍事基地，到2020 年3月底有63人確診感染。甚至有報導提及伊朗軍人在回國後不久就死亡。
現在有一名棄嬰 , 是去被丟包的地點找父母嗎? 是這樣調查的嗎 ?不是 ! 丟包後早就跑了還找得到?
當然是依據 DNA 去找父母
棄嬰病毒當然能 依據 RNA 序列去找親源
比對這個引發 Covid-19的病毒 SARS CoV-2 親戚在那裏 ?
全都在中國
由RNA的排序 , 可以知道親緣關係 , 排出家族分支樹
這個SARS-CoV-2病毒和SARS-1是有親緣關係，但最近它的親屬卻是雲南的RaTG13及廣東的MP789。
研究人員發現時, 是搞不懂一頭霧水 , 一個遠在雲南蝙蝠冠狀病毒RaTG13? 是如何能和遠在千里之外?還不同種動物身上的冠毒-廣東的穿山甲MP789 雜交在一起? 還交換了基因 ?
最後在武漢造成大流行 ?
SARS-2病毒的全基因序列和RaTG13最像最接近,有96%相似，但S蛋白卻降低到只有89.56%相似?然而,卻和另一種MP789的S蛋白有96.8%相似？
SARS-CoV-2 RBD shows a closer similarity to MP789 CoV RBD (96.8% homology) than to RaTG13 CoV RBD (89.56% homology)
紅框這幾個位點,MP789和SARS-2吻合, 而與RaTG13不同
就像是把MP789的S蛋白切下來裝在RaTG13上的嵌合病毒！
下面這一篇報告比對了Bat-CoV-RaTG13、Bat-CoV-ZXC21、Bat-CoV-ZC45、SARS-CoV 和 pangolin-CoV-2020等5種病毒
PLoS Pathog
2020 May 14;16(5):e1008421. doi: 10.1371/journal.ppat.1008421. eCollection 2020 May.
Are pangolins the intermediate host of the 2019 novel coronavirus (SARS-CoV-2)?
上方是比對 核苷酸nucleotide , 下方比對 氨基酸 Amino Acid
100% 是以 SARS-2為準 , 比對
Bat-CoV-RaTG13、Bat-CoV-ZXC21、Bat-CoV-ZC45、SARS-CoV 和 pangolin-CoV-2020
它和這些病毒的差異
綠線表示SARS-CoV，
灰線表示Bat-CoV-ZXC21，
黃線表示Bat-CoV-ZC45，
橙線表示穿山甲-CoV-2020，
淺藍線表示Bat-CoV-RaTG13；
橙線穿山甲-CoV-2020 和 淺藍線Bat-CoV-RaTG13 和 100% 的SARS-2 最接近在最上方
請看 RBM 那一區 , 所有線都掉下來 , 包括淺藍的RaTG13 , 只有橙線橘色的穿山甲-CoV-2020(MP789)持平, 核苷酸nucleotide維持約90%, 而氨基酸 Amino Acid接近100%,橘色曲線沒有掉下來
那一個比較接近 ? 圖型很清楚
再看
BMC Res Notes. 2020; 13: 398.
Published online 2020 Aug 27. doi: 10.1186/s13104-020-05242-8
PMCID: PMC7450963
PMID: 32854762
The receptor binding domain of SARS-CoV-2 spike protein is the result of an ancestral recombination between the bat-CoV RaTG13 and the pangolin-CoV MP789
該實驗拿武漢-滬-1號病毒 序列做為研究圖中的參考序列(基準)。
使用 MAFFT v7.3 比對和分析序列，並使用 BioEdit v7.2 和 Jalview v2.11 進行編輯。
用j Modeltest2程序確定序列集的核苷酸替換模型，並使用Mr. Bayes程序獲得系統發育樹。
標有 (?) 的黑色小圓圈表示 SARS-CoV-2_Wuhan_Hu-1、RaTG13、RaTG13、MP789 和 RmYN02 的假設祖先。數字表示分隔每個單倍型的突變數量
單倍型網絡顯示穿山甲群和 4 個假設的祖先單倍型之間形成了一個環，表明在該簇內發生基因交換。此外，該網絡表明此分析的 4 個分離株（SARS-CoV-2、RaTG13、MP789 和 RmYN02）與這 4 個假設的祖先不同。
儘管 SARS-CoV-2 和 RaTG13 CoV 的基因組核苷酸同一性為 96.2% ，S 基因核苷酸同一性為 93.15%，但在系統發育樹和單倍型網絡規則中, 顯示出差異, 找出這兩個分離株之間的直接親本關係。
將 SARS-CoV-2 與 RaTG13 和一組穿山甲 CoV 進行比較時，S 基因出現負選擇
在 SARS-CoV-2、RaTG13 和 MP789 之間進行了 MK 測試，結果表明 SARS-CoV-2 和 RaTG13 CoV 之間的同義（dS）替換多於非同義（dN）替換，表明負選擇（NI > 1). 然而，在 SARS-CoV-2 和 MP789 CoV 之間發現了相反的情況，表明正選擇（NI < 1）
SARS-CoV-2 預測的負選擇是由於其與 RaTG13 CoV 的高度相似性，因此，不支持 dN 替換的固定。
儘管 RaTG13 蝙蝠 CoV 的 S 蛋白與 SARS-CoV-2 的 S 蛋白具有高度核苷酸同一性，但系統發育樹和單倍型網絡表明這些 CoV 之間存在非直接親子關係。
如何解釋 SARS-CoV-2 和 MP789 CoV 之間顯示正選擇（NI < 1）, 非同義（dN）替換多於同義（dS）替換, 有異於SARS-CoV-2 和 RaTG13 CoV 之間的負選擇（NI > 1) ?
蝙蝠RaTG13(淡藍線) 是最接近SARS-2的病毒 , 但是在嵌合ACE2的這一段位點 , 相似度突然和 SARS-2不像了
如果補上了 MP789 (橘色線)的這一段 , 那就又完全和 SARS-2相像了
SARS-CoV-2很可能通過重組從MP789穿山甲CoV獲得了S蛋白受體結合域（RBD）的基本功能，並且高度保守。
這樣拿一種病毒S蛋白,置換在另一個載體病毒上的特徵, 不就是 符合
石正麗的博士生曾磊平博士论文「蝙蝠SARS樣冠狀病毒的反向遺傳學系統的建立及ORFX功能研究」：
﹝將選定的 12个S（即尖峰编码）基因，并将它们插入另一种冠状病毒WIV1得到的重組嵌合病毒﹞
網路上曝光了一份 ,紐約生態健康聯盟 (EHA) 的英國籍主席 Peter Daszak提交給國防高級研究計劃局 (DARPA)的撥款提案。
﹝外洩文件：武漢科學家想把可由空氣傳播的冠狀病毒顆粒釋放到蝙蝠洞穴﹞
https://www.mobile01.com/topicdetail.php?f=814&t=6457653&p=6&uid=456370
Peter Daszak 何許人 ? 是和武漢病毒所的石正麗的博士有長達15年合作的學術統包商
在武漢病毒爆發前一年, Peter Daszak 就提出一份計劃要向美國申請錢
Project DEFUSE Defusing the Threat of Bat-Borne Coronaviruses
“DEFUSE計劃”尋求確定蝙蝠來源冠狀病毒為“威脅”的外溢風險，但最終因風險過高被美國所拒絕了
但是在這份申請書中 , 洩漏了許多細節都不謀而合, 讓人懷疑
武漢病毒研究所的實驗室，一直在做基因工程冠狀病毒去攻擊人體細胞的工作。稱之為"功能增強性研究gain-of-function experiments"
把一個不會感染人的病毒, "功能增強性gain-of-function "後去攻擊人體
我們怎麼能這麼確定？
因為 研究基金是來自 美國國立衛生研究院 (NIH) 下屬的國家過敏和傳染病研究所 (NIAID) 的資助。原本撥款給紐約生態健康聯盟的主席 , 英國科研者Daszak 博士，承包商 Daszak 博士又將其轉包給了武漢病毒研究所的石博士。由於提供資金的撥款提案是公共記錄的問題，必須向美國國會具體說明她計劃用這筆錢做什麼。因此留下了書面紀錄。
2018 和 2019 財年撥款的摘錄如下。“CoV”代表冠狀病毒，“S 蛋白”是指病毒的刺突蛋白。
“對 CoV 種間傳播的測試預測。宿主範圍的預測模型（即出現潛力）將使用反向遺傳學、假病毒和受體結合分析，以及來自不同物種和人源化小鼠的一系列細胞培養物的病毒感染實驗進行實驗測試。”
“我們將使用 S 蛋白序列數據、感染性克隆技術、體外和體內感染實驗以及受體結合分析來檢驗 S 蛋白序列中百分比差異閥值, 以預測溢出(spillover)潛力的假設。”
用非技術語言來描述上列文字，石博士打算著手創造對人類細胞具有最高感染力的新型冠狀病毒。她的計劃是採用編碼刺突蛋白的基因，這些基因對人類細胞具有從高到低的各種可測量的親和力。她會將這些刺突基因一個一個地插入到許多病毒基因組的骨架中（“反向遺傳學”和“傳染性克隆技術”），從而創造出一系列"嵌合病毒"。然後將測試這些嵌合病毒攻擊人類細胞培養物（“體外”）和人源化小鼠（“體內”）的能力。這些訊息將有助於預測病毒“溢出spillover”的可能性，即冠狀病毒從蝙蝠傳播到人類。
檢索相關論文發現，他們使用一種 HIV 假病毒來表達 7 種蝙蝠 b-ACE2 受體，並將它們的結合人類 h-ACE2 受體特性，以便選擇最好的受體，以進一步優化 SARS 樣冠狀病毒結合人體細胞的能力。 他們還發現，一些蝙蝠 ACE2 受體與人類 ACE2 受體非常接近。 這項研究提供了一個模型系統，在 2005 年至 2013 年間對中國蝙蝠種群的大量調查中 , 選擇已經用於測試的最具傳染性的 SARS-CoV 樣病毒。（Xu L 等，2016）。 這些病毒可能通過 ACE2 受體感染人類。 2012-2015 年間發現了更多新病毒（Lin etal，2017）。
在TA1要做什麼? 申請文件寫
We will sequence their spike protein, reverse engineer to conduct binding assays, and inset them into bat SARSr- CoV (WIV1, SHC014) backbones (these use bat-SARSr-CoV backbones, not SARS-CoV, and are exempt from dual use and gain of function concerns) to infect humanized mice and assess capacity to cause SARS-like disease.
我們將對它們的刺突蛋白進行測序，逆向工程進行結合測定，並將它們插入蝙蝠 SARSr-CoV（WIV1、SHC014）骨架（這些使用 蝙蝠bat-SARSr -CoV 骨架，而不是 SARS-CoV，並且免於雙重用途和功能增強）感染人源化小鼠並評估引起 SARS 樣的疾病
也和石正麗的博士生曾磊平博士论文所做的實驗 ﹝將選定的 12个S（即尖峰编码）基因，并将它们插入另一种冠状病毒WIV1得到的重組嵌合病毒﹞,是相同的
基因分析SARS-CoV-2 這個病毒, 同樣是以 蝙蝠RaTG13病毒為骨架 , 再加上穿山甲冠狀病毒MP789的S蛋白
這篇申請書還出現熟悉的 WIV1, SHC014
2011年4月至2012年9月，中國科學院武漢病毒研究所石正麗實驗室的研究人員於中國雲南昆明採集中華菊頭蝠的腸道與糞便樣本，病毒的樣本感染Vero E6細胞，成功分離出病毒，並在電子顯微鏡下觀察到病毒顆粒，將其命名為WIV1病毒, 序列分析結果顯示WIV1病毒的序列與Rs3367幾乎相同。
2012年,在同一地點的雲南,就爆發了一起病例, 礦工未知病毒引發的重症肺炎共6例
雲南昆明醫科大學的李旭 發表的碩士論文《未知病毒引起重症肺炎6例分析》,描述此種在會造成白肺的病毒
https://www.mobile01.com/topicdetail.php?f=780&t=6371784&p=7#81995615
熟諳的SHCO14 又出現了 ?
2015年武漢病毒所石正麗，與北卡羅來納大學教堂山分校一起聯合進行”增強功能實驗”。 他們操縱蝙蝠病毒創造了一種適應小鼠的新型嵌合病毒SHC014-MA15 , 能在人類上呼吸道細胞（2B4 Calu-3 - Chapel Hill 提供的細胞系）上增殖
發表於 Nature Medicine
《A SARS-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergence》
該論文中描述，是Zheng-Li Shi 石正麗博士“提供了SHC014 刺突序列和質粒”。
事實上，嵌合病毒(RaTG13+MP789)這正是 SARS-CoV-2 的特性。
﹝但曾磊平博士論文卻說,石正麗提供的 SHC014 不是自然病毒 , 是將選定的 12个S（即尖峰编码）基因，并将它们插入另一种冠状病毒WIV1得到的重組嵌合病毒﹞
2017年 ,石正麗的博士生曾磊平博士论文「蝙蝠SARS樣冠狀病毒的反向遺傳學系統的建立及ORFX功能研究」写道："为了估计类似SARS的蝙蝠冠状病毒对人类的潜在威胁，我们从不同的冠状病毒毒株中选择了12个S（即尖峰编码）基因，并将它们插入WIV1(Rs3367)（另一种冠状病毒）的基因组框架中，作者说，"我们成功地获取了其中四个，分别将其命名为Rs4231、Rs4874、Rs7327和RsSHC014病毒株。"
Peter Daszak 拿2017年武漢病毒所已經做出來的東西再向美國申請錢?
在Daszak申請書的 TA2 中，
Peter Daszak說將評估兩種減少洞穴蝙蝠 SARSr-CoV 排毒的方法：
(1) Broadscale immune boosting, in which we will inculated bats with immune modulators to upregulate their innate immune response and downregulate viral replication;
(1)大規模免疫增強，我們將給蝙蝠接種免疫調節劑，以上調它們的先天免疫反應並下調病毒複製；
(2) Targeted immune boosting in which we will inoculate bats with novel chimeric polyvalent recombinant spike protein plus the immune modulator to enhance innate immunity against specific,high- risk viruses.
標靶免疫增強，我們將用新型嵌合多價重組刺突蛋白和免疫調節劑接種蝙蝠，以增強對特定高危險病毒的先天免疫。
We will trial inoculum delivery methods on captive bats including novel automated aerosolization system, transdermal nanoparticle application and edible adhesive gels
我們將在圈養蝙蝠上試驗接種遞送方法，包括新型自動噴霧氣化系統、穿透皮膚納米顆粒應用和可食用粘性凝膠。
We will use stochastic simulation modeling informed by field and experimental data to characterize viral dynamics in our cave test sites, maximize timing, inoculation protocal, delivery method and efficacy of viral suppression. The most effective biologicals will be trialed in our test cave site in Yunnan Province, with reduction in viral shedding a proof-of-concept.
我們將使用由現場和實驗數據提供信息的隨機模擬模型來表徵我們洞穴測試地點的病毒動力學，最大限度地提高病毒抑制的時間、接種方案、遞送方法和功效。最有效的生物製品將在我們雲南省的測試洞穴中進行試驗，減少病毒排毒是一個概念證明。
novel automated aerosolization system, transdermal nanoparticle application and edible adhesive gels
接種遞送方法，包括新型自動噴霧氣化系統、穿透皮膚納米顆粒應用和可食用粘性凝膠
原本冠狀病毒 是飛沫傳染 , 飛沫不過1-2m就會掉到地面, 要如何自動噴霧氣化系統隨空氣去接種遞送?
這正好說明『靜電吸附』, 能黏在灰塵上, 隨氣流飛 , 所謂"氣溶膠"
SARS-CoV-2病毒的特性 : S蛋白帶正電 , 會黏
與 SARS-CoV-1 相比，SARS-CoV-2 的S蛋白上一連串的帶正電群的肝素結合位點 , 可能介導了與肝素的增強相互作用，並且這種變化是通過少至兩個氨基酸取代 Thr444Lys 和 Glu354Asn 演變而來的。
SARS-CoV-2 顯示帶有一群 正電荷(顯示為藍色) 而 相比之下SARS-CoV-1並無增強的正電荷
這個病毒的S棘蛋白上有一排4個連續帶正電的胺基酸, 具有"靜電吸附"的能力, 就算產生中和抗體, 病毒照樣粘上人體細胞
https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acs.jpcb.2c01048
能以"氣溶膠"黏上來 ，能躲過抗體綑綁。
Signal Transduction and Targeted Therapy volume 6, Article number: 39 (2021)
Engaging the spikes: heparan sulfate facilitates SARS-CoV-2 spike protein binding to ACE2 and potentiates viral infection
受體 ACE2 結合位點的旁邊, 就是帶負電HSPGs硫酸類肝素與S蛋白帶正電氨基酸群的接合位點, 兩者彼鄰,所以HSPGs 也加強了 ACE2 受體的結合
這『靜電吸附』造成免疫系統 擋不住 病毒入侵 和繁殖
這『靜電吸附』造成打任何廠牌的疫苗雖然擋不住感染 , 病毒仍然會進入人體被驗到PCR陽性。
居然2018年 , Peter Daszak 的申請書就提及 能以空氣噴霧來傳染 ?
申請書 也明白寫了 ,
The most effective biologicals will be trialed in our test cave site in Yunnan Province,
最有效的生物製劑將在我們的雲南省試驗洞穴現場進行試驗
Dr. Shi, Wuhan Institute of Virology will conduct viral testing on all collected samples, binding assays and some humanized mouse works.
武漢病毒所石博士將對所有採集的樣本進行病毒實驗、結合試驗和部分人源化小鼠工作。
最早,中國送至基因銀行的基因定序,出身證明的名稱就自稱是 Wuhan-hu-1武漢-滬-1號病毒 , 登錄在GenBank: 編號 MN908947.3
名稱就是武漢病毒 , 現在依然如此登錄
這個病毒 是不是原配生的? 有沒有婚外情? 有沒有去醫院去做人工生殖 ? 看它的RNA鹼基排列就能比對出來。
這個病毒有沒有親戚 ? 有 , 病毒資料庫中最近的親戚就是 RaTG13 (之前稱BtCoV / 4991)
是 石正麗 發表在《Nature》 volume 579, pages270–273 (2020)的論文自己說的
for all sequences—RaTG13 is the closest relative of 2019-nCoV
對於所有序列——RaTG13 是 2019-nCoV 的最近親屬
for all sequences—RaTG13 is the closest relative of 2019-nCoV and they form a distinct lineage from other SARSr-CoVs
對於所有序列——RaTG13 是 2019-nCoV 的近親，它們形成了與其他 SARSr-CoV 不同的譜系
全部都是 石正麗自己說的
然而,RaTG13正是2012年,也就是武漢病毒爆發的7年前 , 雲南昆明醫科大學 發表的碩士論文《未知病毒引起重症肺炎6例分析》, 採樣送到武漢病毒所的病毒
https://www.mobile01.com/topicdetail.php?f=780&t=6371784&p=7#81995615
當時負責治療生病礦工的醫師李旭曾多次諮詢其他中國專家意見，並用上呼吸器、抗凝血劑、類固醇及抗生素等治療，並說在中國抗疫專家鍾南山的監督之下，礦工們接受肝炎、登革熱及愛滋病毒檢測，之後相關單位把染病礦工的組織樣本送往武漢病毒研究所，確定是一種類似SARS的冠狀病毒，而李旭也撰寫論文研究。
而當時那個同樣會造成"白肺"的未知病毒, 病徵和7年後的武漢病毒是一樣的!
這個不能稱為武漢病毒的新冠病毒SARS-CoV-2病毒 ,有5個奇怪特徵, 很難以自然演化或突變來解釋
(1)SARS-CoV-2有獨特的Furin弗林蛋白酶裂解位點
問題是基因序列有 96%相同的 RaTG13 , 身為SARS-CoV-2最近的親戚及其它冠狀病毒, 卻都沒有 "弗林蛋白酶" ? 與它的近親相比，SARS-CoV-2這個弗林蛋白酶位點對是全新的
那麼 , 沒有 荷蘭人的紅髮基因 ? 沒有來自泉州大食(色目人,眼睛有顏色)祖先 , 卻生出紅棕髮藍綠眼的小孩?基因從那裏來的? 辯稱這沒有婚外情? 沒有人工生殖? 都推給是突變嗎 ?
一般的突變, 不一定是有意義的, 有時只是亂碼 , 但這個 RBD 區 被插入的 PRRA 是有意義的 ,這個 PRRA 的插入 , 能夠引進一種 furin 弗林蛋白酶的內切酶
一次突變 12個鹼基 ? 而且插入在特定位置上,讓 刺突蛋白的S1和S2亞基, 在正確的位置被裂解開 ? 這四個 PRRA 氨基酸 同時發生自然突變 ? 機率有多高 ? 10億分之一
除了突變, 另外能解釋的可能，這個 Furin弗林蛋白酶 是和其它病毒交換而來, 當兩種病毒碰巧侵入同一個細胞時，它們的後代與屬於另一個的 RNA 片段組裝在一起。β-冠狀病毒只會與其他β-冠狀病毒結合，但可以通過重組獲得集體基因組庫中幾乎所有存在的遺傳元素。他們無法獲得基因庫中沒有的元素。問題是, 並沒有已知的 SARS 相關 β 冠狀病毒（SARS2 所屬的類別）具有弗林蛋白酶裂解位點。 那麼 這個Furin弗林蛋白酶是從那裏憑空交換而來?
(2)密碼子問題
SARS-2 弗林蛋白酶裂解位點的被插入的"密碼子" , 是進一步縮小了自然出現起源的可能。
眾所周知（或者至少可以從高中生物回憶起），遺傳密碼使用三個 DNA 單位來指定蛋白質鏈的每個氨基酸單位。當以 3 組為一組閱讀時，4 種不同的 DNA 可以指定 4 x 4 x 4 或 64 個不同的三聯體，或稱為密碼子。由於只有 20 種氨基酸，因此有足夠多的密碼子可供使用，因此某些氨基酸可以由多個密碼子指定。例如，氨基酸精氨酸可以由六個密碼子 CGU、CGC、CGA、CGG、AGA 或 AGG 中的任何一個命名，其中 A、U、G 和 C 代表 RNA 中四種不同的單位。
不同的生物有不同的密碼子偏好。人類細胞喜歡用密碼子 CGT、CGC 或 CGG 指定精氨酸。但 CGG 是冠狀病毒最不受歡迎的精氨酸密碼子，只佔了5% 。
現在，功能性的原因使得 SARS2 具有弗林蛋白酶裂解位點 ，而其表親病毒卻沒有（在電腦資料中）。將其基因組中近 30,000 個核苷酸的基因組與其表親冠狀病毒的基因組對齊來比較。迄今為止已知的最接近的是一種叫做 RaTG13。與 RaTG13 相比，SARS2 在 S1/S2 連接處有一個 12 個核苷酸的插入片段。插入序列是 T-CCT-CGG-CGG-GC。CCT 編碼脯氨酸，兩個 CGG 編碼兩個精氨酸，GC 是編碼丙氨酸的 GCA 密碼子的開頭。
這個插入片段有幾個奇怪的特徵，但最奇怪的是兩個並排的 CGG 密碼子。SARS2的精氨酸密碼子中只有5%是CGG，在其他任何β冠狀病毒中都沒有發現雙密碼子CGG-CGG。那麼SARS2是如何獲得一對受人類細胞青睞但不受冠狀病毒青睞的精氨酸密碼子呢？
(3)原始SARS2棘蛋白上多出6個胺基酸,其中4個都帶有正電, 來的演化株帶更多正電荷
武漢冠狀病毒的棘蛋白上有4種並列的胺基酸且都帶有正電，這使得病毒能夠牢牢『靜電吸附』吸附於人體細胞帶負電的部分，抗體並無法中和靜電吸附 ,造成病毒不需要"受體"就能黏上人類細胞 , 為此還新創了一個『氣溶膠』的名詞 ; 這是新冠病毒傳播能力特別驚人的原因。
『靜電吸附』才能解釋SARS-2為何能額外結合非ACE2受體的細胞，例如攻擊味覺的苦/甜特異性受體/輔助受體 , 造成失去味覺。
由於帶正電的胺基酸會互相排斥，如同磁鐵正極放在一起會彈開, 因此自然界中連3個排成一列的狀況很少見，更何況新冠病毒有4個並排，是絕無僅有。
怒駁扯上高端 王必勝：不是不買BA.5疫苗！現在除美國沒人買得到
https://www.mobile01.com/topicdetail.php?f=814&t=6658773&p=2#85784367
那一個位點帶電, 能量為多少?能吸引到相對於人類細胞那一個受體位置, 每一篇都有資料
這個病毒的S蛋白帶正電荷 , 因此逃脫抗體綑綁
這個病毒 在S蛋白RBD區遠端帶有正電荷群, 能『靜電吸附』
這一群帶正電氨基酸 K444 R509 R346 , R355 K356 R357 R466 , 在目前的流行株Omicron不但沒有改變,還增加到9個位點帶正電, 和之前的Alpha,Delta一樣,完全能 "靜電吸附", 能以"氣溶膠"黏上來 , 而不需經"ACE2受體"這個門戶相嵌合，能躲過抗體綑綁。
如圖K444 R509 R346 , R355 K356 R357 R466(綠色) 這幾個帶正電荷位點, 不是在接合ACE2(紫色)的位置上, 而是位於遠端 , 就算就算綁住了S蛋白RBD去嵌合ACE2 ,這個遠端還能有"額外"的"靜電吸附"力
有三種帶正電荷的氨基酸 , 分別是 別為組胺酸H（Histidine）、離胺酸K（Lysine）和精胺酸R（Arginine）
比較18年前的 SARS-1 和 帶正電荷的SARS-2 在RBD區,帶電位點的氨基酸排列
紅框是對正電荷有影響的位點,和 SARS-CoV-1 帶電相比，SARS-CoV-2 有增強的正電荷群(圖H 藍紫色顯示帶正電荷,紅色顯示帶負電荷) , 相對之下, SARS-1 的S蛋白上藍紫色區分散而且少。
這一群帶正電氨基酸 K444 R509 R346 , R355 K356 R357 R466 和肝素的結合數 及 使用分子操作環境 (MOE) 軟體評估肝素-蛋白質接觸和能量貢獻表明, 與帶正電荷的氨基酸 R346、R355、K444、R466 和可能的 R509 有很強的相互作用。 其所貢獻的能量 如圖示
帶電會如何?
『抗體』就算綁住了S蛋白去嵌合ACE2 , 但這遠端還是能"黏"上帶負電的HSPGs ,造成逃脫"抗體"綑綁
和 SARS-CoV-1 帶電相比，SARS-CoV-2 有增強的正電荷群 , 能黏上 帶負電荷的 硫酸乙酰肝素蛋白聚醣HSPGs,與之結合，獨立於結合Spike棘蛋白ACE2受體的模式 ，利於 SARS-CoV-2 黏上人類細胞 , 以雙重結合模式去感染人類細胞。
造成了"突破性感染"
液遞免疫, 釋放到細胞外液的『抗體』會被逃脫 , 當然病毒能一次又一次侵入到細胞內 ，所以病毒一定會突破人體阻絕境外的抗體, 一定會跑進來 , 造成感染數目一定會很高
由過去武漢病毒研究所 發表過的論文有那些 ?
法國世界報 , 批漏了 石正麗 指導的研究生 的三篇論文
https://www.rfi.fr/cn/中国/20210527-covid-19溯源-武汉病毒研究所未发表的三篇论文遭披露-事故假设被重提
第一篇
其中一位喻萍的碩士論文，「蝙蝠SARS樣冠狀病毒的地理進化研究」研究了當時2012年，從雲南墨江通關鎮這個地方，所分離的一些病毒株。她實際上有對四個病毒株，來自雲南墨江的病毒株進行全基因組的測序，這個在石正麗的所有的文章中，沒有這麼完整的說明過。
石正麗在2020年回答《科學》雜誌的時候，她說Ra4991就是RaTG13。可是這一次《世界報》，比較研究生論文發表出來的序列，和RaTG13這二個序列之後，發現一個非常有意思的事情，二者用來感染人的那部分的這種蛋白，差異有多大，1%～1.5%，科學家解釋這樣的差異需要進行十次到十五次的變異才能達到這樣的變化，可是石正麗親口講，這二個是同一個病毒? 在實驗室內都沒有"繼代"過嗎 ?
第二篇 武漢病毒實驗室早就具有 改變病毒S蛋白 去嵌合 ACE2 受體的能力
如果這個野生病毒株沒有接合 ACE2 受體的能力 ? 那就給它一個 ACE2受體能結合的蛋白
2008年Wuze Ren等人在病毒學期刊上, 成功展示了在蝙蝠 SARS 樣病毒和人類 SARS 病毒之間交換 RBD 的技術能力：“......
發現最小插入區（氨基酸 310 至 518）足以將 SL-CoV S 從非 ACE2 結合轉化為與人類 ACE2 結合，表明 SL-CoV S 與 SARS-CoV S 在很大程度上兼容蛋白質的結構和功能。
J Virol. 2008 Feb; 82(4): 1899–1907.
Difference in Receptor Usage between Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus and SARS-Like Coronavirus of Bat Origin▿
（Wuze Ren , 等人，中國科學院武漢病毒研究所2008 年）。
Wuze Ren，中文 : 任武澤，中國科學院武漢病毒研究所石正麗研究員2004~2007年指導的博士研究生，曾獲2007年中國科學院院長獎學金優秀獎、湖北省優秀博士學位論文獎。
2008年石正麗的博士生任武澤 , 成功展示了在蝙蝠 SARS 樣病毒和人類 SARS 病毒之間交換 RBD 的技術能力：“......
發現最小插入區（氨基酸 310 至 518）足以將 SL-CoV S 從非 ACE2 結合轉化為與人類 ACE2 結合，表明 SL-CoV S 與 SARS-CoV S 在很大程度上兼容蛋白質的結構和功能。
法國世界報批漏 这三篇论文中，2017年的博士论文「蝙蝠SARS樣冠狀病毒的反向遺傳學系統的建立及ORFX功能研究」最顶尖；它利用了嵌合病毒构建技术，即一种 "复制粘贴"的方式。中国研究人员的目标之一是测试不同冠状病毒对几种类型的人类或动物细胞的感染性，而这取决于嫁接在同一病毒骨架上的「編碼基因」。
论文作者曾磊平写道："为了估计类似SARS的蝙蝠冠状病毒对人类的潜在威胁，我们从不同的冠状病毒毒株中选择了12个S（即尖峰编码）基因，并将它们插入WIV1（另一种冠状病毒）的基因组框架中，作者说，"我们成功地获取了其中四个，分别将其命名为Rs4231、Rs4874、Rs7327和RsSHC014病毒株。"
石正麗的實驗室已經展示, 任何冠狀病毒都能換上 RBD 區的編碼 ,就有ACE2的強結合 ?
有?或是沒有 ACE2結合力 ? 完全都是可以在實驗室內"複製貼上" , 是完全可以自行控制的, 不必天然病毒
SHC014 又出現了 ?
再對照回到 石正麗於 2015年 發表於 Nature的重組嵌合病毒（稱為 SHC014--MA15）?
石正麗博士與北卡羅來納大學著名的冠狀病毒研究人員拉爾夫·S·巴里克 (Ralph S. Baric) 合作。他們的工作重點是增強蝙蝠病毒攻擊人類的能力，以“檢查正在傳播的蝙蝠 CoV [冠狀病毒] 的出現潛力（即感染人類的潛力）。”
為實現這一目標，他們於 2015 年 11 月創造了一種新型病毒，採用 SARS1 病毒的骨架並將其刺突蛋白替換為來自蝙蝠病毒（稱為 SHC014-CoV）的刺突蛋白。這種人造病毒能夠感染人類呼吸道的細胞，至少在針對此類細胞的實驗室培養物進行測試時是如此。
Nature Medicine 的這一篇報告 , 就提到它們還有 編碼新型，人畜共患的冠狀病毒刺突蛋白的嵌合病毒-(SHC014-MA15）
《A SARS-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergence》
新的人畜共通的的嵌合病毒 (SHC014-MA15）是將SARS病毒的刺突蛋白 ，替換為來自蝙蝠病毒（稱為 SHC014-CoV）的刺突蛋白 ?
對照曾磊平的論文 , 是將基因（即尖峰编码）插入WIV1（另一种冠状病毒）的基因组框架中 ? 去得到 SHC014 ?
原本以為是 天然蝙蝠病毒的 SHC014-CoV ? 卻是曾磊平选择了12个S（即尖峰编码）基因，并将它们插入WIV1另一种冠状病毒, 所變出來的實驗室嵌合病毒?
石正麗 拿了這種嵌合病毒 SHC014-CoV 再去和SARS嵌合? 再變出 (SHC014-MA15）人畜共通的的嵌合病毒 ?
(4)對蝙輻細胞的感染力弱? 親和力只有對人類細胞的1/10
如果是從蝙輻來的病毒 ,應該很擅長感染蝙輻 , 但是香港做了實驗 ,13種蝙輻當中,只有2種蝙輻能被感染?
且感染力不強 , 只有感染人的 1/10 ? 對人類細胞的感染力最強 !
因為 RBD 區的編碼被換了
(5)找不到由蝙蝠跳到人類之間的中間宿主 ?
micli1973 wrote:
當下沒有藥可以處理 所以西方藥廠才需要研發針對性
但好笑的是
幾十年的西方老藥 跟中醫 方劑 竟然能療癒治癒
完全看不懂邏輯 ? 病毒性的疾病都能有抗病毒藥物嗎 ?
請參考文獻
Available Compounds With Therapeutic Potential Against COVID-19: Antimicrobial Therapies, Supportive Care, and Probable Vaccines
對 COVID-19 具有治療潛力的可用化合物：抗菌療法、支持性護理和可能的疫苗
下圖: SARS-CoV-2 的生命週期及其可能的抑製劑。SARS-CoV-2的S 蛋白與由絲氨酸蛋白酶 TMPRSS2 引發的細胞的血管緊張素轉化酶 2 (ACE2) 結合。
病毒 RNA 在細胞質中出現以產生 PP1a 和 PP1ab 多蛋白，它們被切割形成非結構蛋白。
這些非結構蛋白通過複製和轉錄過程促進負股 RNA 的形成。這反過來又轉化為 N 蛋白。
另一組翻譯進入內質網-ERGIC-高爾基體以產生結構蛋白（S、M 和 E）。
最後，用 N 蛋白包裝病毒 RNA 並進一步組裝 S、M 和 E 蛋白，出芽形成 SARS-CoV-2 ，通過胞吐作用從受感染的細胞中釋放出來。
顯示在不同階段抑制 SARS-CoV-2 的各種藥物是 CQ/HCQ, Chloroquine氯喹//Hydroxychloroquine羥氯喹; ；L, Lopinavir洛匹那韋；R1,Ritonavir利托那韋；I, Ivermectin;伊維菌素；R,Remdesivir瑞德西韋，R2,Resveratro白藜蘆醇；D,Darunavir達蘆那韋；C,Camostat卡莫司他; ;F, Favipiravir法拉匹韋。
那麼, 輕症連藥都沒吃就自己好了的, 還有感染了自己完全沒感覺,是檢驗了才知道無症狀感染 , 該如何解釋?
micli1973 wrote:
有效 卻是被處處打壓
疫情開始 花蓮慈濟中西醫合璧的處置方式 全員康復
單純西醫 致死率高到離譜
但"未符不"無視此一利眾消息(新聞我找不到了花蓮慈濟醫院的新聞)
代表水很深
COVID-19之後
多少年後
新的代號是.......
在台灣 ,病患可以自由選擇 中醫或西醫 治療 , 何來打壓
單純西醫 致死率高到離譜 ?此種說法從何而來?
比較要放在同一個天平上 ,這個病重症是要上呼吸器 , 呼吸器是中醫還是西醫 ?
2020年4月海軍磐石軍艦人員，3月5日啟航，4月9日返國, 在海上1個月, 這個病的潛伏期只有5天, 艦上推測已經傳播了4波疫情。共發現36名病毒核酸檢驗陽性之確定病例（男性32名，女性4名，年齡介於20多歲至40多歲），其中8名血清抗體陽性病例 , 表示早已經自行復原 , 都在船上, 這是中醫還是西醫 ?
micli1973 wrote:
教育界新秀殞落！政大...(恕刪)
〔即時新聞／綜合報導〕英超聯賽16日魯頓對陣伯恩茅斯賽事，於下半場第65分鐘時發生魯頓29歲隊長、後衛洛克伊爾（Tom Lockyer）心臟驟停事件，幸好最終沒有大礙。
https://sports.ltn.com.tw/news/breakingnews/4523357
個人觀點喜歡就拿去用!用就是你的了!
鄭郁蓁／台北報導 2023年12月27日 週三 上午4:10...(恕刪)
新聞不是重點就不貼內文了，而是底下的回覆，現在疫苗話題很冷，還可以有這樣多的回覆數。
疫苗有這麼好，結果看不到疫苗施打率，也看不到報銷多少疫苗。來本版推銷打疫苗的，不敢說自己打了幾劑或發表自身打疫苗後的實際效益。沒口碑的疫苗，想要業績只有奇蹟。
前天回南部鄉下，還有一半以上的人在空曠戶外戴口罩。疫情初起北部人戴口罩時南部人都很少戴，可見台灣的資訊時間差真的很嚴重。
這是台灣區的疫苗施打統計，可惜只到去年9/26。
看接種率即可知，越來越多人認清疫苗對疫情沒鳥用，光靠鬼扯是無助於疫苗兩光的事實。
內文搜尋
從 APP 打開
X