體積小巧的 Joy-Con 搖桿雖是專為 Switch 設計，讓使用者玩遊戲時手腕和手臂可不占空間、自由擺動，但它們其實也可以利用藍牙和電腦配對後玩 PC 遊戲。首先須先將搖桿和 Switch 解除配對，左右搖桿從 Switch 卸下後，在內側 SR 鍵、SL 鍵之間找到一個黑色小按鈕，長按幾秒，搖桿的指示燈便會閃爍，代表該搖桿已和 Switch 解除配對並進入可搜尋模式，這時只要開啟電腦的藍牙設定頁面，就能找到左右 Joy-Con 搖桿配對。
仍須設定對應按鍵
雖然 Joy-Con 搖桿可經藍牙和筆電配對，不過配對完成後，電腦只會將 Joy-Con 認定為「藍牙裝置」，並不會將其設定成「搖桿」，這時候無法使用 Joy-Con 玩任何 PC 遊戲。如果想用 Joy-Con 來玩電腦遊戲，需要另在電腦使用搖桿模擬器軟體，設定 Joy-Con 不同按鍵的對應功能。
網路上這類型模擬軟體很多，下載模擬器軟體並開啟以後，就可在軟體介面找到對應兩個 Joy-Con 的搖桿設定頁面，幫每個搖桿按鍵設定對應按鍵時，可按 Joy-Con 上任一按鍵以快速在軟體中找到對應的按鍵指令；此外，也能針對遊戲預先設定搖桿紀錄檔，要玩不同遊戲時，只要快速選擇對應的紀錄檔，即可在不同遊戲使用 Joy-Con 搖桿玩遊戲。
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