研發替代役的選擇

背景：
大學及研究所都是四大，不過大學時並非資工系，但研究所是資工所。
履歷基本上看起來是個有1~3年工作經驗的系統軟體工程師...不過是今年要畢業的新鮮人。
民國82年底出生...最後一屆的1年兵，研替是3年。

問題：
剛升碩二時，有找到某IC大廠(簡稱A)在內湖的研發替代役，原本預計今年就要去內湖工作三年了，
但是前陣子被另一個IC大廠在新竹(簡稱B)的主管發現我的論文成果，就給了口頭offer(明年研替)，
想要我拋棄A，去他們那邊繼續我的研究。

不過問題來了，A其實早已被B併購(不論去哪工作，以後都會說我在B工作)，正職薪水完全一樣，如果要拋棄A，
必須要技術性延畢，然而因為大公司是以學歷敘薪，需要技術性延畢的6個月，B公司願意以長期實習生的身分聘，
但是薪水只有3萬(大學生學歷)，而正職如果把非經常性薪資也平均算進去，其實大約是可以領到3~4倍的實習生(大學生學歷)薪水。

也就是工作內容上，我個人認為繼續我的論文研究，去B公司上班，似乎研究上比較有前景
(非錢景，因為全世界可能只有少數幾個人在做類似的事情，感覺以後也不可能換到類似的工作)，
但是今年11月~明年5月都只能領3萬/月，看著旁邊的人做差不多的事，但至少領3倍以上的薪水...

以A公司第一年新人半年大約能領到55萬左右，B公司因為實習生的身分，只能領18萬，還要繳2次研究所學費(共4萬)，
外加新竹市(清大這邊)租房(10-12坪，2人住)8000/月 對比 內湖13000/月，42(6個月實習+3年)個月差21萬，
還有伙食費差距，因為A公司午餐要出去吃(晚餐免費提供)，B公司是午晚餐都在公司吃(補助一部分)，
我猜內湖每個月大概比新竹市多出2000/月，42個月差約8萬，
交通費的部分都一樣是騎機車，所以就沒差了。

總結來說，實質金錢會差55-(18-4+21+8)=12萬

選A公司，按照預定計畫在內湖上班，會多12萬(還沒算年資會多半年)，而且女友因為是醫學相關科系(物理治療)，
台北的醫院很明顯比較多，似乎工作對她來說比較好找，還有因為沒在台北生活過，可能還有一些新鮮感。
(曾經在台中、台南、新竹 生活過)

選B公司，會少12萬，役期延後半年開始(因為明年第一梯我猜5月)，會擔心之後會不會不想做，但是被綁更久...
工作內容比較具有無法取代性，可是擔心那半年看到旁邊的人，內心會過意不去，明明都做相似的工作，可是我少領3倍...
假日感覺比較無趣，但是研究所沒有白念。

A公司及B公司的職位，都是在各自的 核心軟體技術部門，可是A公司的職位比較偏向我大學自己學的專業，
B公司的職位就完全是我研究所的論文。


請問各位大大，我已經被這問題折磨了好一陣子了，作夢都在想，不曉得有什麼意見能提供嗎？

已經把身邊的工程師朋友們(A、B公司的都問了)問過一輪了，
工作順遂的就會說，能夠把專業有延續性很重要，支持B公司。
如果不順利的，就會說，A比較實在，早點結束早點脫離。

去年找工作，拒絕了11個B公司的機會以及3個A公司的機會，好不容易才在15個機會中選定目前的A公司缺...



謝謝各位的寶貴意見