JB手機直接更新韌體4.3.3for3GS

最近使用JB後的3GS 4.3.1(redsn0w_win_0.9.6rc9)
發覺實在太耗電了
所以昨天決定更新看看4.3.3
於是乎沒經驗的我
就直接給他在itunes上按 更新韌體
想不到更新完成後
使用到現在一切都正常
但發覺手機裡似乎有一些空間還是被Cydia給佔住了(?)
我想應該是沒完全覆蓋過去
現在有兩個問題想請教
1.如果我不JB，那手機裡的cydia檔案要如何清理掉?
2.如果我在JB一次，那之前安裝的功能都還在嗎?