是長短腳的問題?還是姿勢的問題?

想請問各位大大

小的今年34
身高:185公分
體重:98公斤

大學(球隊),當兵(憲兵),出社會前三到四年(球隊)都有跑步習慣(3-5K 每個禮拜3-4次)
目前每個禮拜固定打兩次全場籃球
出社會十年大概胖了10公斤左右

由於明年初要參加公司的籃球賽
因此這一個月開始跑步練練體力
第一個禮拜跑大概只能跑1.5-2K
第二個禮拜開始可以固定跑3K
後兩個禮拜看時間體力跑3-5K
(禮拜天到三跑步,禮拜四五打兩小時全場籃球不跑,禮拜六休息,穿低筒籃球鞋跑社區的石面路)


但是從一開始跑的時候
跑不完就是因為左腳小腿肌肉超級痛又很緊
跑完洗完澡早就不會痛
隔天右腳膝蓋就悶悶的一整天
但跑時沒感覺
就算跑了一個月後
還是一樣的狀況

我知道我本身有點長短腳
以前總被人說我三七步
但其實是因為右腳比較長
如果立正站好,左腳跟是沒有著地的(但差幾公分倒是沒有去量過,大概3公分左右吧)
另外右腳前掌及腳跟都是繭
但左腳完全沒有(跑了一個月後好像前掌有一點)
所以我在猜想是不是由於長短腳的關係導致這樣的情況?
還是單純因為姿勢的關係(習慣用右腳發力?我起跳抓籃板基本上也是用右腳?)

由於對生活沒有太大影響,所以應該不會打算矯正或特別去做鞋墊
(但我以前就猜測我椎間盤突出跟左腳習慣性扭傷應該是這樣造成的)
如果還想維持運動練練體力,各位大大是建議我穿個護膝?換個鞋子?
還是乾脆改成游泳等其他運動來維持體力??

還請各位大大建議一下!!感謝