請教~為什麼新組的電腦十分的遲鈍

最近小弟新組了一部電腦相關配備如下

CPU:AMD PhenomII X4 955
RAM:ADATA 4G DDRII800
MAIN:ASUS M4A78 PLUS
VGA:ASUS GTS250 512MB
HD:WD 500G 7200RPM 16MB
OS:Windows 7

剛開始的時候使用起來十分的順暢
可是最近發生了一點問題讓小弟我百思不得其解
一般來說小弟的電腦會發生LAG的情形
通常是在運算大量資料(打電動，影像處理)或是搬運大型檔案的時候
但是小弟這部電腦最近常常無緣無故的硬碟的工作指示燈就亮在那邊然後電腦就完全沒反應
而當下通常只是在上上網或是看看電影的時候就會發生
針對這個情形小弟也有開啟資源監視的程式
當硬碟顯示忙碌的時候CPU的運作也只有20%~30%左右(CPU省電功能已經關閉)
另外小弟的筆電為Z46，基本上來說硬碟的效能和桌機應該差不多卻不會有這種情形

小弟經爬文後歸納了以下幾個可能:
1.Windows 7一定有甚麼小弟還不知道的祕密
2.小弟在電腦裡面安裝了甚麼相衝突的程式(可是Z46和桌機上面裝的程式都差不多)
3.ASUS提供的一些效能監控軟體影響了系統效能(很想不要用可是停用之後真的吵到不行)
4.中毒了??小弟有安裝小紅傘和PC TOOLS SPYWARE DOCTOR兩套軟體，顯示無毒
5.硬體有問題?? HD不夠快?? RAM太LOW??

因為電腦內已經花了很多時間安裝很多的軟體實在很不想重新安裝作業系統
想請板上的先進提供新的看法或是解決方案，感激不盡!!