小弟女友(簡稱MG)目前在營造公司上班，職位為會計
因老闆人品問題而導致她上班情緒不佳，故想在過年後就不幹了
其實，MG在半年前就已提出離職申請(但只是口頭上的預告)，而公司之前也說過會請新人進來
之後卻也沒有進行積極的僱員動作
在今天(2/12)的晚上，MG就打電話給公司的副董(老闆的兒子，簡稱GY)，並提出離職申請
而MG跟GY說，她想在二月底(2/28那天)離職
現在卡到一個問題，在今年2月1日的時候，MG有簽一份聘僱契約書
上面的第六條寫到：
乙方自請離職，須依甲方規定1.試用期30天 2.正職人員60天 3.管理職90天 前提出辭職書並確實完成個人工作相關交接事宜後，方可離職
可是，GY嗆她，離職必須照契約書走，否則算是未完成工作交接，會先寄存證信函
並提出因MG擅自離職而造成公司的損失，會依法跟MG求償，甚至還嗆說會想辦法找到MG家裡
所以，目前有了一些問題想請教各位大大：
1. 提出離職申請是否用書信比較好?亦或是MAIL也可以當作存證呢?
2. 如果照契約書走，就必須待滿60天才能離職，也就是4月13日才能離職
如果按照二十天的規定來走，大概會在3月4日那天可以離職
但在電話中，MG被威脅了，心灰意冷之下想在過年後就不去了，也就是2月21日就不去公司
選擇哪一種會比較好呢?
3. 因公司遲遲不請新人，又在2月1日那天逼迫MG簽下契約書
而之前的口頭提出離職申請(已超過三個月)，在法律效力上算數嗎?
4. 如不遵守契約書的話，公司提出賠償請求大約會多嚴重呢?
5. 因工程延宕關係，MG每天加班到晚上8.9點，卻因公司未設置簽到退簿或打卡機，無法證明加班時間
如此可向公司求償加班費用嗎?
小弟在網路上有爬過相關文章，有人說存證信函不具法律效力所以不用緊張
但我怕GY人後續會想賤招搞死MG
我該用哪種方式來為MG解圍呢?
請各位大大幫我集思廣益ˊˋ
拜託各位了~~~
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