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人體腸道住滿無比巨量的微生物，包括細菌、病毒、黴菌、原蟲、寄生蟲。單就細菌而言，數目就高達百兆以上，種類千百種，重量達1公斤之上，細菌的代謝副產物還提供人體10%熱能來源。人體70%以上的免疫細胞都在腸道，腸道是人體最大的免疫器官，而腸道菌整體可視為人體的一種器官，而且是十大必要器官之一（註）。
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近年以色列團隊有一項有趣的人體試驗，讓受試者徹底清腸後再給予抗生素，盡量將原本的腸內細菌都清除了，然後Ａ組給予益生菌，Ｂ組則不吃益生菌，實驗結果發現，有吃益生菌的Ａ組，恢復到原本的腸道菌相還比較慢。所以到底吃益生菌好不好？仍留待更多研究解答。
Q什麼樣的食物對腸道健康有益？
A蔬菜水果還是公認最好的，過去認為蔬果的好處是含有豐富的維他命、礦物質，現在發現蔬果含有的植化素（Phytochemicals）、多酚類、膳食纖維，可以提供腸道菌好的養分來源，特別是可以產生短鏈脂肪酸等有益物質。所以，飲食方面可能沒有什麼新的選擇，但基本的概念還是攝取多種顏色蔬果，如此不僅確保纖維足夠，也能吃到多種不同的植化素，有助於腸道菌叢的均衡發展。
Q有人說吃瀉藥後再吃益生菌，效果比較好？
A目前並沒有任何實驗研究可以證實先透過吃瀉藥清腸或吃抗生素等方式，讓原本腸道菌種減少，會增加益生菌的效用。這派的說法，主要是基於「定殖（Colonization）」的概念，也就是先清掉原本的「住戶」後，吃進去的益生菌就比較有機會住下來，稱為「定殖」。但重點還是，這隻菌之前有沒有做過嚴謹的研究，有沒有帶來你想要的健康益處？如果沒有，定殖下來也沒有什麼好處。
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