p5kpl(ver 1.0) 裝兩個硬碟出了問題

煩請大大幫幫我

主機版：P5KPL
cpu： Intel Core 2 Duo E6550 2.33GHz
記憶體：1GB DDR2 *2 跑雙通
顯示卡：GALAXY GTS 450
硬碟：1.日立 250 GB 存系統 SATA介面 轉速6XXX rpm
2.日立 1 TB 存影音 SATA介面 轉速7200 rpm
光碟機：SONY DVD RW DRU-880S SATA介面

狀況:

小弟我的電腦三個星期前更新了顯卡、光碟機順便重灌os，只是好景不常...

至到一個星期前它開使出狀況了!

執行應用程式一段時間開始LAG 只是LAG都是一瞬間 ，然後重開機時它就跑出下列這段話

Reboot and select proper Boot device or Inesert Boot

Media in selected Boot device and press a key

看到這段文字頓時頭大了...我就進入bios看，發現他沒有抓到存放系統的那個硬碟(250G)

反而只有讀到1T的那個硬碟。之後反覆重開數次有後有時後讀的到，有時後不到。

我想說是不是中毒了，掃毒掃整天的都掃到，乾脆就再重灌一次...其結果還是一樣...

之後我就乾脆把的影音的那顆碟拿掉。就都正常了...

現在問題是要怎麼能夠讓兩個硬碟都裝上去正常使用呢?

我SATA接的位置如下：

[250G] [DVD RW]
SATA1 SATA2

[1T] [空]
SATA3 SATA4

補充一下：

重灌之前我更新硬體後使用一段時間都沒有問題才重灌。