4TB GPT磁碟內的部分資料夾看不到，有辦法修復檔案配置表嗎？

我有一顆新的4TB硬碟，使用GPT格式，單分割區，放在一台7歲的Win 2003 Server上作為備份用硬碟，磁碟代號為F:，然後我建立了一個BackupDir資料夾，透過網芳的方式從別台Server(相同規格)，用TeraCopy複製2.65TB的資料到該硬碟。複製過程中有出現錯誤，我用檔案總管無法看到該顆硬碟的內容，出現「無法存取F:\。檔案或目錄損毀而且無法讀取。」，但之後又自動繼續複製檔案。

複製完成後，我在命令提示字元測試了一下：

dir F:\	找不到檔案
dir F:\BackupDir	可以看到目錄內容
dir F:\BackupDir\SomeSubDir1	找不到檔案
dir F:\BackupDir\SomeSubDir2...	可以看到目錄內容

用檔案總管還是無法看到該顆硬碟的根目錄內容，但是如果我手動輸入路徑，大部分的目錄都可以看到內容，甚至可以打開檔案。如果使用chkdsk會出現「檔案系統的類型是 RAW。CHKDSK 無法供 RAW 磁碟機使用。」。

一般來說，大部分的救援軟體都著重在從受損磁碟中取出資料，不過因為這顆硬碟是二線備份，所以內容倒是還好，只是複製比較花時間。所以我想問的是，有沒有軟體可以修復檔案配置表本身，讓磁碟內容可以正常讀取呢？

額外資訊：
DISKPART> list part

磁碟分割 ### 類型 大小 位移
------------- ---------------- ------- -------
磁碟分割 1 保留 128 MB 17 KB
磁碟分割 2 主要 3726 GB 129 MB

DISKPART> sel par 2

磁碟分割 2 是所選擇的磁碟分割。

DISKPART> detail partition

磁碟分割 2
類型 : ebd0a0a2-b9e5-4433-87c0-68b6b72699c7
隱藏 : 否
必需的: 否
屬性 : 0x0000000000000000

磁碟區 ### Ltr 標籤 Fs 類型 大小 狀態 資訊
---------- --- ----------- ----- ---------- ------- --------- --------
* 磁碟區 1 F VideoBackup NTFS 磁碟分割 3726 GB 狀況良好