將汽車燃料費改為「隨油徵收」的困難處，主要在於逃漏稅與走私風險高、營業用車（如客運、貨運）成本大增引發物價波動，以及政府稅收不穩定。此外，若油價隨稅浮動，將對民生物價造成直接衝擊。
「隨油徵收」難以實施的具體原因如下：
稅收容易流失： 燃油用途廣泛，若將稅金加在油價上，會導致農機、漁船、發電機等「非道路行駛」的油料遭到重複或不公課稅，且容易衍生油品走私或非法逃漏稅問題。
物價轉嫁壓力： 營業大客車、計程車及貨運業的油耗量龐大。若全面改為隨油徵收，會大幅增加運輸成本，業者勢必將成本轉嫁至票價與運費上，進而引發全面性的通貨膨脹。
衝擊財政穩定： 地方政府憂心稅收會因民眾減少開車而變得不穩定，且大眾運輸工具若需另外補貼減免，會造成財政劃分與管理的困難。
電動車普及問題： 隨著電動車數量增加，若只對燃油徵稅，將無法向電動車主收取道路養護費用，造成「使用者付費」原則的漏洞。基於上述徵收漏洞與社會衝擊，中華民國交通部目前已傾向以更精準的「隨里程徵收」方案，取代傳統的隨油徵收提案。
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