潘文忠在記者會中表示，安排經濟艙沒讓選手獲得最好照顧，的確思慮不周，向所有奧運代表團國手鞠躬致歉。事實上，體育署先前僅說教練和隊醫搭商務艙，然而攤開36人名單，卻發現有7人並非教練團或隊醫，包括：支援工作團團員劉慶文(國家運動訓練中心副執行長）、團長林鴻道、總領隊蔡辰威、中華奥會秘書長李玉芳、副總領隊洪志昌(體育署副署長)、顧問藍坤田(體育署組長)、顧問李文彬(國家運動訓練中心執行長)。
體育署今天以包機模式，讓參加東京奧運的台灣代表隊最大團安全抵達日本，不過因為座位的安排，讓所有選手都坐在經濟艙，這一舉動令「世界球后」戴資穎都感到相當意外。畢竟選手們以往出國比賽，由於航程遙遠，都會搭乘商務艙，一來可以在飛行時獲得更好的休息，也可以順便調整時差等因素。
體育署長張少熙表示，選手經濟艙、教練商務艙的考量，是因商務艙有36個位置，有6位醫生，23位教練、7位隊職員（總領隊、總團長、署裡的人員），經防疫協調官建議，擔心選手染疫會連帶影響比賽表現，所以選手的前後左右都是沒有人的，這是當時安排最大考量。
潘文忠則說，這次確實是因為疫情嚴峻，經過防疫團隊討論，認為專機方式比較可避免和其他旅客接觸產生染疫危機，但專機有限制，所以無法讓選手全都搭乘商務艙。確實專機在防疫上是有需求跟必要性，但也應優先考量有需求的選手，要和選手討論溝通。而後續較後面梯次的賽程，也已規劃好和訂票，選手不論出發或結束回國都會搭乘商務艙。
張少熙也說，7月12日行前說明會就已經和教練跟選手溝通過商務艙座位有限的問題，可能是當時表達不夠清楚，傳達上有疏忽，還有些人沒有到現場，種種因素體育署都會深切檢討。
中華台北東京奧運專機商務艙乘客完整名單如下：
團長 林鴻道
總領隊 蔡辰威
中華奥會秘書長 李玉芳
副總領隊 洪志昌(體育署副署長)
顧問 藍坤田(體育署組長)
顧問 李文彬(國家運動訓練中心執行長)
柔道隊教練 劉文等
跆拳道總教練 劉祖蔭
游泳隊總教練 李澄峯
射擊隊教練 郭孟熙
射擊隊教練 田兆枝
划船隊教練 謝茂松
網球隊教練 詹元良
體操隊總教練 林育信
體操隊教練 翁士航
體操隊教練 蔡恆政
舉重隊總教練 林敬能
舉重隊教練 黃達德
射箭隊總教練 林政賢
射箭隊教練 倪大智
射箭隊教練 劉展明
羽球隊總教練 蔡佳欣
羽球隊教練 賴建誠
羽球隊教練 樂勁
桌球隊總教練 許榮展
桌球隊教練 蔣澎龍
拳擊隊總教練 柯文明
拳擊隊教練 曾自強
拳擊隊教練 劉宗泰
隊醫 林瀛洲
隊醫 林聖章
物理治療師 趙遠宏
支援作團防疫協調官 張煥禎
支援工作團醫師 周文毅
支援作團醫師 郭純恩
支援工作團團員 劉慶文(國家運動訓練中心副執行長)
荒腔走板
