蘇花改現行僅限小客車、大客車通行，不過交通部公路總局第四區養護工程處交通管理及控制中心指出，遇到特殊情況下將開放機車、大貨車借道蘇花改，還有一套明確的配套措施。
交控中心指出，台9丁線（舊蘇花公路）蘇澳至東澳段發生阻斷狀況，且經評估搶通時間若超過4小時，將與相關單位啟動應變機制，開放機車、大貨車「有條件」通行蘇花改。
機車部分，騎士須配合交管指示在蘇花改兩端集結，在指定時間內採「團進團出」的方式通行，交控中心將指派公務車及警車以「前導後護」的方式，戒護通行。大貨車部分則由交控中心引導，靠右車道進入地磅站管制並配合儀控通行，並與前車保持150公尺至200公尺的距離。
交控中心補充，至於油罐車等載運危險物品的車輛，除非舊蘇花公路中斷長達幾天才會有條件開放通行蘇花改，且必須事先向運地或車籍所在地公路監理機關申請核發臨時通行證，並於指定時段採「前導後護」方式通行。
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