電腦菜鳥想請教一個關於系統硬碟的問題

小弟電腦是微星GL62VR 7RFX這台筆電，由於最近跑程式都覺得電腦負擔重，跑不快甚至會卡，因此看了一下效能，使用軟體時優使用HDD效能，儘管小弟灌在SSD裡面。。。
請問有大大知道如何使電腦或程式優先使用SSD嗎？BIOS開機碟確實是SSD，但不知道為什麼使用軟體都是吃HDD的效能。。。
因為小弟桌機組裝完沒這問題，不知道這台筆電為什麼會這樣很費解。。。

補充一下：
C槽（SSD 128g)目前剩餘62g左右
D槽 （HDD 960g)目前剩餘650g左右

在此電腦菜鳥先謝過各位大神了。